強化財政國庫管理信息化建設、促進國庫管理科學化是構建現代國庫管理制度的客觀要求。國庫集中收付制度改革10年來，財政國庫信息化取得了顯著成效，地方國庫支付系統已發展成綜合性的預算執行管理系統，有力支撐了地方財政國庫管理的改革與發展。隨著國庫集中收付改革向“橫到邊、縱到底”全面推進，國庫收付管理的工作效率及信息反饋等要求不斷提高，適應新形勢、新情況，建立更加安全、規范、高效的財庫收付管理新模式已成為地方財政部門的迫切要求。在中央成功實施財庫業務無紙化管理，部分地方開始嘗試推進相關工作的基礎上，改革現行地方國庫半手工、半電子的業務管理方式，隨著大力推進國庫支付業務無紙化管理系統的建設，國庫集中支付系統的安全問題越來越被重視。

為進一步深化國庫集中支付管理制度改革，保障財政資金安全、提高資金撥付效率、方便預算單位用款，國家財政部于2011年提出在全國推行國庫集中支付電子化管理改革，通過實行國庫集中支付電子化管理，建立新型安全管理信任體系。